关于单细胞转录组测序(scRNA-seq)外送检测项目招标公告(略)-(略)-(略) (略):(略)
台州市第一人民医院
(单细胞转录组测序(scRNA-seq))委托外送检测
公开招标文件
| 项目编号: | (略)-(略)-JN | |
| 编制日期: | (略)年9月 (略)日 | |
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招标公告
一、项目基本情况
台州市第一人民医院拟开展一项关于痛风病人的基础研究,送检(略)个病人血样,进行scRNA+scATAC监测,委托外送检测。
二、单细胞转录组测序(scRNA-seq)技术参数要求:
1.单细胞转录组样本处理
(1)使用GEXSCOPE?组织解离液进行组织解离得到细胞悬液。
(2)使用Countstar荧光细胞计数仪结合显微镜对细胞悬液进行质检;采用荧光技术原理同时检测采购方样品的细胞悬液浓度、细胞活性、结团率,细胞直径分布,有无红细胞污染等重要指标,样本要满足建库要求。
2. 单细胞转录组文库构建
(1)具备Singleron Matrix NEO?文库构建系统,基于微流控微孔板技术原理完成细胞分离,使用GEXSCOPE? Single Cell RNA Library Kit 单细胞转录组试剂盒完成建库。
(3)采用安捷伦核酸片段分析仪((略))对样本cDNA和构建好的文库进行文库质量检测,对符合标准的文库进行后续的上机测序。对符合合格标准(活性≥(略)%,细胞浓度≥(略)5/ml)的样本,目标捕获细胞数不低于(略)/样本。
3. 单细胞转录组数据产出
(1)要求使用Illumina Novaseq测序平台进行测序,测序策略为PE(略)。
(2)测序质量要求:(略)
4. 单细胞转录组结题报告展示
数据下机后,对测序数据进行质量评估,并出相应的质控结题报告来展示项目的有效数据量、测序质量、捕获细胞数、中值基因数等全面的数据产量及质量信息。
5.数据保存时限
在项目完结交付原始数据后,可保存原始数据(略)天。
6.售后服务团队安排及响应时间要求
投标方需为本项目配备足够的售后服务团队,在项目完结的6个月内,如采购方有需求,可向采购方提供免费的结题报告内的项目咨询以及技术支持服务。
投标方售后服务响应时间:(略)
单细胞染色质可及性测序(scATAC-seq)技术参数要求:
1.单细胞染色质可及性测序样本处理
(1)新鲜样品保存及运输:(略)
(2)新鲜样本单细胞悬液制备:(略)
(3)单细胞核悬液制备:(略)
(4)在单细胞核悬液制备完成后,使用荧光染料对细胞核染色后,使用细胞计数仪及荧光显微镜对样本的单细胞核悬液进行质检,并且采用荧光技术原理同时检测样品的细胞核浓度,细胞核活性,成团率,细胞核直径分布,有无红细胞污染等重要指标以满足建库要求。
2.单细胞染色质可及性测序文库构建
使用Singleron Single Cell ATAC Library Reagent Kit建库试剂盒,利用Tn5转座酶特性,将含有测序接头的序列引入到转座区域。然后捕获转座后的产物,从而构建单细胞ATAC文库。
3.单细胞染色质可及性测序数据产出
对于质检合格的文库使用Illumina测序平台对单细胞ATAC文库进行高通量测序,测序策略采用PE(略),测序数据量不少于(略)G/样本。
4.单细胞染色质可及性测序结题报告展示
数据下机后,对测序数据进行质量评估,并出相应的质控结题报告来展示项目的有效数据量、测序质量、捕获细胞数等全面的数据产量及质量信息。
5.数据保存时限
数据保存时限:(略)(略)天。
6.售后服务团队安排及响应时间要求
投标方需为本项目配备足够的售后服务团队,在项目完结的6个月内,如采购方有需求,可向采购方提供免费的结题报告内的项目咨询以及技术支持服务。
投标方售后服务响应时间:(略)
三、标书要求:(略)
3.1正本需加盖投标单位红章,并有授权代表签字。投标文件副本为正本(确保正本已完成签字、盖章等所有文件编制工作)的复印件;如正本副本装订完成后仍有修改的,正本、副本同时修改,并在修改处签字、盖章。
3.2投标文件页码顺序如下:
1、封面;2、报价一览表(竞标单位自制);3、投标人营业执照、授权代表法人委托书(含身份证复印件)、本项目涉及的相关资质文件;4、投标技术参数响应情况;5、同类项目近一年的合同书(建议三份或以上);6、其它需说明的资料。
3.3投标文件封面标明:
1、招标编号:
2、项目内容:
3、投标单位全称:(略)
5、日期:
四、需准备现场PPT介绍,公司资质、同类项目开展情况、公司优势等。
五、潜在供应商有意向参与竞标,请予发送(略)月(略) 日前《报名表》填写后发至(略)@qq.com.。
六、本项目开标时间定于(略)年(略)月(略)日上午8:(略)
开标地点:(略)
七、评标方法:(略)
八、不明事宜,请联系项目负责人:(略)