国家医学检验临床医学研究中心数据平台技术参数(国产1套)
一、总体要求
1.本项目所建设医学检验数智化协同创新平台需按招标人要求部署在指定位置,包括多中心数据集成工具、数据治理工具、数据筛选工具、数据补录等数据处理工具,同时部署统计学、机器学习等数据分析工具。支持检验中心和网络成员(略)人并发调用,为重大疾病及感染性疾病的自主创新检验标志物及检验技术的开发、检验项目参考区间建立技术及检验技术和产品的多中心临床评价研究提供扎实的数据与工具支持;支持对图像原文件进行集成接入,支持与数据库内患者数据进行关联,浏览,制备。
2.数据平台支持临床文本、影像数据的集成与查看,支持对文本与影像DICOM进行集成接入、tag结构化生产,并支持在数据库应用层检索、查看、制备;支持对图像原文件进行集成接入,支持与数据库内患者数据进行关联、浏览及制备。
★3.本项目需要支持集成主流基于B/S架构的科研工具,实现科研需求与专业工具的高效对接(提供承诺函并加盖投标人公章)。
4.投标人所提供的患者服务应用软件必须符合《信息安全技术网络安全等级保护基本要求》,并承诺配合招标人按照等级保护要求对软件进行升级改造。
★5.实施期间,投标人应根据招标人需求对软件功能进行升级改造服务(提供承诺函并加盖投标人公章)。
★6.投标人应对该系统提供终身技术支持,配合本项目建设科室新流程需求和指标项目的新增与调整,所有费用纳入到年维护费中,不再另行收费(提供承诺函并加盖投标人公章)。
二、主中心数据采集治理平台
1.自动化集成治理
1.1数据集成:(略)
1.2数据治理:(略)
2.专病数据结构化生产
2.1专病数据模型建设:(略)
2.2数据架构化生产:(略)
▲2.3支持对影像DICOM进行集成接入、tag结构化生产,支持在数据库应用层检索、查看、制备;支持对图像原文件进行集成接入,支持与数据库内患者数据进行关联、浏览及制备(根据参数描述要求提供系统截图并加盖投标人公章)。
3.数据自动化更新
3.1数据增量集成:(略)
3.2数据增量治理:(略)
3.3数据增量结构化:(略)
3.4更新周期T+N:(略)
三、分中心数据采集治理平台
1.线下数据文件提供
▲1.1提供专病数据集需求调研、数据分析、数据集方案设计等服务,满足对数据字段的个性化设计需求(提供承诺函并加盖投标人公章)。
1.2提供数据表单配置服务,通过线上/线下会议讨论形式、可视化数据表单配置形式进行字段集设计效果的确认。
1.3提供数据集上线后的字段变更修改服务。
1.4支持将分中心以线下积累的患者结构化数据(Excle格式)批量导入数据库,并进行数据入库的相关校验与审核,对数据格式等进行修改,确保导入数据的准确性。
▲1.5支持患者检查数据与影像图像数据关联处理(根据参数描述要求提供系统截图并加盖投标人公章)。
2.线上人工数据录入
▲2.1分中心数据补录:(略)
2.2分中心权限管理:(略)
3.线上数据库采集
形式同主中心,支持数据自动采集、治理、结构化生产、数据更新。
四、数据平台应用层功能
1.数据资产
1.1汇交概览:(略)
1.2数据质控报告:(略)
1.3数据字典:(略)
2.科研数据中心
▲2.1灵感发现:(略)
▲2.2数据驾驶舱:(略)
▲2.3检索:(略)
▲2.4患者全景:(略)
▲2.5多中心/单中心回顾性研究:(略)
▲2.6多中心/单中心前瞻性研究:(略)
3.平台管理
3.1权限管理:(略)
3.2中心管理:(略)
3.3系统管理:(略)
五、数据分析工具
1.临床数据处理
1.1变量处理:(略)
1.2变量自定义:(略)
1.3离群值处理:(略)
1.4缺失值处理:(略)
1.5样本处理:(略)
2.统计学分析
2.1描述性统计:(略)
▲2.2显著性分析:(略)
▲2.3ROC曲线:(略)
▲2.4相关性分析:(略)
2.5一致性检验:(略)
2.6逻辑回归分析:(略)
2.7生存率分析:(略)
2.8Cox比例风险回归:(略)
2.9多元回归分析:(略)
▲2.(略)参考区间建立:(略)
2.(略)变异来源分析:(略)
3.机器学习
3.1配置因变量:(略)
3.2配置临床变量:(略)
3.3配置组学特征滤波变换:(略)
3.4配置组学特征类型:(略)
3.5配置模型验证方法:(略)
3.6特征清洗:(略)
3.7特征相关性分析:(略)
3.8特征筛选:(略)
3.9特征降维:(略)
▲3.(略)机器学习模型:(略)
▲3.(略)模型调参:(略)
▲3.(略)全局超参搜索:(略)
3.(略)模型效果评价:(略)
3.(略)混淆矩阵:(略)
3.(略)特征权重分析:(略)
3.(略) ROC曲线:(略)
▲3.(略) PR曲线:(略)
3.(略)决策曲线:(略)
3.(略)校准曲线:(略)
▲3.(略)诺模图:(略)
3.(略)模型训练日志:(略)
3.(略)数据下载:(略)
3.(略)报告下载:(略)
3.(略)模型下载:(略)
▲3.(略)外部验证:(略)
3.(略)外部验证结果下载:(略)
★六、配置
| 软件名称 | 一级模块 | 二级模块 | 数量 | 单位 |
| 国家医学检验临床医学研究中心数据平台 | 主中心数据治理平台 | 自动化集成治理 | 1 | 套 |
| 专病数据结构化生产 |
| 数据自动化更新 |
| 分中心数据采集治理平台 | 线下数据文件提供 |
| 线上人工数据录入 |
| 线上数据库采集 |
| 数据平台应用层功能 | 数据资产 |
| 科研数据中心 |
| 平台管理 |
| 数据分析工具 | 临床数据处理 |
| 统计学分析 |
| 机器学习 |
七、售后服务
★1.本项目旨在建设一个面向六大类重大疾病(恶性肿瘤、代谢性疾病、呼吸系统疾病、心脑血管疾病、自身免疫性疾病及感染性疾病)及健康人群的高质量检验数据平台,覆盖总样本量至少5万例。鉴于本平台为长期科研基础设施,后续将根据科研需求持续数据治理及数据分析工作,投标人项目进入质保期后配合甲方完成相关数据治理与数据分析需求。本项目软件免费质保3年;提供(略)小时技术支持服务(提供承诺函并加盖投标人公章)。
2.投标人必须根据本次招标文件所制定的目标和范围,提出相应的售后服务方案,并作为投标文件的一部分提交。
3.投标人必须做出培训承诺,须提供免费的系统培训,并详细说明培训计划,通过培训使用户方能独立操作、维护、管理,从而使用户方能独立进行管理、故障处理、日常测试维护等日常工作,确保系统能正常安全运行。
4.工期要求:(略)
5.投标人参与本项目的人员姓名、年龄、学历、职责分工、专业技术培训认证情况、曾参与类似项目所担任的工作等,着重介绍担任本项目的项目经理及各实施阶段负责人情况。项目实施过程中,投标人应严格按照标书中的承诺将人员指派到位,其中项目经理和技术负责人必须专职全程参与本项目的开发、实施过程,未经招标人同意不得更换。须提供免费的系统培训,并详细说明培训计划,通过培训使用户方能独立操作、维护、管理,从而使用户方能独立进行管理、故障处理、日常测试维护等日常工作,确保系统能正常安全运行。
6.在维保期内,基于招标人单位院内专家的临床经验,协助招标人单位共同进行科研方向与方案设计,并协助招标人单位临床专家进行对应科研方向的相关文献的查询、数据统计分析、AI算法建模等服务;协助招标人共同进行相关课题的联合申报。
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